Dentre os fungos causadores da SFA prevalecem os do gênero Aspergillus, sendo o A.furmigatus a espécie mais comum, podendo apresentar-se como micetoma ou invadir os tecidos dos seios paranasais. Estes são tão importantes quanto a Candida sp como causadores de infecções fúngicas. Estes fungos, cosmopolitas, podem causar também reações de hipersensibilidade, pela inalação dos esporos, e proliferação não invasiva dos micélios nas vias respiratórias já lesadas. Podem ser diferenciadas três formas de aspergilose humana: alérgica, colonizante e invasiva.
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